小孩發燒時一般不建議首選通過灌腸退燒，雖然灌腸能夠幫助體溫下降，由于副作用相對比較大，依從性比較差，發熱時如果使用其它的治療方法，例如口服退熱藥物不能緩解，無法進食，意識不清，可能會選擇灌腸進行降溫。造成的副作用可能有以下兩方面：1、損傷腸道：灌腸時通常使用冷鹽水通過物理方法降溫，另外也可以使用退熱藥物，例如對乙酰氨基酚的肛栓，降低體溫，上述方法可能都會造成肛門和直腸不同程度的損傷；2、排便異常：灌腸還可能造成后期排便出現異常。如果口服退熱藥不能控制發熱或者無法口服藥物時，可以選擇將灌腸作為必要的選擇手段。多數小孩使用肛腸進行退燒，依從性可能較差，同時也無法自行在家里進行，可操作性要比口服退熱藥物更難。