男性小腹疼痛的原因，常見的包括以下幾點：1、腸功能紊亂：小腸出現失節律性收縮，正常人的小腸會進行3-5次/分的有節律性收縮，如果腸功能紊亂，小腸收縮的節律發生改變，有時可能會達到7-8次/分，甚至＞10次/分，這時小腹就會出現疼痛的感覺，可以進行腸功能紊亂的糾正，口服藥物，補充益生菌，糾正腸功能紊亂，菌群失調，通常可以取得不錯的治療效果；2、腸道炎性病變：如直腸、乙狀結腸出現病變，患有直腸炎、乙狀結腸炎，還常見于潰瘍性結腸炎的情況，小肚子也會出現疼痛；3、腸道占位病變：如果出現直腸腫瘤性病變，如直腸腺瘤、直腸癌、乙狀結腸腺瘤、乙狀結腸癌等，也會引起小肚子疼痛，可以進行結腸鏡檢查明確診斷；4、男科疾病：例如膀胱炎、膀胱腫瘤、精囊腺炎、前列腺腫瘤、前列腺炎等病變，也會引起男性小腹疼痛。