男生陰莖上長小肉粒，在臨床上主要考慮以下兩大類疾病：1、尖銳濕疣：這是性傳播疾病，是由HPV感染導致。這一類男生通常有不潔的性接觸或者性伴侶眾多，在陰莖、龜頭、冠狀溝、尿道外口，甚至在肛周有小的菜花樣腫物，可以做HPV的快速鑒定。如果明確診斷了以后，就按照尖銳濕疣來進行治療。一般是根據疣的大小治療，大部分都可以用激光、冷凍，甚至局麻下手術的辦法來予以切除，切除之后，再在創面上涂抹5-FU軟膏(5-氟尿嘧啶軟膏)，這樣就會減少繼續復發的可能。在治愈之后，建議男生一定要潔身自好，否則這一類的尖銳濕疣非常容易復發。如果有可能，建議男生的性伴侶也到醫院做檢查，否則容易發生交叉傳染，造成疾病反復復發；2、毛囊炎：在男生的陰莖、陰囊等生殖器官分布著很多的汗腺，這些毛囊一旦感染，局部可能會出現紅腫、疼痛的現象，一般考慮是在毛囊的局部細菌感染導致。所以推薦使用百多邦(莫匹羅星軟膏)、紅霉素軟膏等進行外抹治療。