直腸癌術后多數患者需進行化療，而化療藥物引起的后續反應與化療藥物的種類有關。直腸癌化療藥物如奧沙利鉑、氟尿嘧啶類藥物和伊立替康均可產生副反應。比如奧沙利鉑具有神經毒性，伊立替康可引起腹瀉，氟尿嘧啶類藥物可引起心臟類毒性，此外，這些化療藥物常見的毒副作用包括胃腸道反應、肝腎毒性等。 隨著生物治療技術的進展，血管靶向藥物、上皮間質轉化抑制劑在臨床使用的范圍越來越廣泛，因此需注意個別藥物出現的副反應。如西妥昔單抗可出現皮疹、腹瀉等常見副作用，血管靶向類藥物需注意避免出現出血風險。