對于電子結腸鏡首先要進行腸道準備，腸道準備是否徹底直接影響到電子結腸鏡的觀察。對于正常排便的病人，可以一次性進行清潔，通過口服瀉藥進行處理。如果是患有慢性便秘的病人，需要至少分2-3次進行自上而下的腸道清潔，大量糞液儲存在腸道內腔之中會嚴重影響內鏡下的觀察，甚至影響內鏡的通過，遺漏病變，因此是術前準備的非常重要的一點。 也需要注意如果存在大便性狀改變，或者發生便血，或者是有慢性便秘，再有腹部不適，還有突然出現消瘦的患者都需要進行結腸鏡檢查。如果是既往存在過結腸息肉病史的患者，或者是家族中直系親屬存在患有結直腸癌的病人，都需要及時進行結腸鏡的檢查，以防這種息肉越長越大，最終發生癌變。