扁桃體癌與其他癌癥類似，早期癥狀并不十分典型，可能表現為咽炎癥狀，如咽部異物感，吞之不下、吐之不出。另外也可以表現為急性或慢性扁桃體炎的癥狀，此時疼痛以局部疼痛為主，檢查時可能發現扁桃體膿腫增大。隨著病情的發展，癥狀會逐漸表露出來，此時可與以上疾病相鑒別。扁桃體癌常為單側發病，且多為鱗狀細胞癌，檢查時可發現腫塊外生，或單側扁桃體表面看到菜花狀新生物。扁桃體癌也可能以頑固性、潰瘍性為主要表現的癌癥，在晚期可能引同側引流淋巴結腫大，腫大的淋巴結通常質地較硬，與周圍組織粘連嚴重，在B超檢查時，可進行診斷性穿刺活檢以進行鑒別。如果出現咽部不適、扁桃體區域不適，此時不能僅靠癥狀判定是否為癌癥或良性，應到正規醫院就診進行檢查。