顱內動脈瘤好發于腦內血管分叉部。該部位是血流動力學最容易發生動脈瘤的部位，長期受到血流沖擊會導致血管壁發生形態上的改變，其中又分為頸內動脈系統和椎基底動脈系統。 由于頸內動脈系統血流量大，發生動脈瘤的幾率比椎基底動脈系統高。椎基底動脈系統的血流只有頸內動脈系統的1/2-1/3，因此椎基底動脈系統發生動脈瘤的幾率低于頸內動脈系統。