兒童根尖周囊腫發病并不多，主要發生于恒上前牙區。根尖周囊腫大小不定，可由豌豆到雞蛋大。小囊腫在牙齦表面多無異常表現，囊腫發展較大時，可見患牙根尖區牙齦處呈半球狀隆起，囊腫過分增大時，因周圍骨質吸收并壓迫鄰牙，造成鄰牙移位、松動與傾斜或鄰牙牙根吸收。 如果囊腫發展到更大時，表面骨質變為極薄骨板，捫診時可有乒乓球樣感覺并發出所謂羊皮紙樣脆裂聲。最后此層極薄骨板也被吸收時則可發生波動感，當下頜囊腫發展過大，骨質破壞過多時，可能引起病理性骨折，上頜骨囊腫可侵入鼻腔和上頜竇，而使眼球受到壓迫影響視力甚至產生復視。