陰莖短小的臨床診斷是指陰莖在勃起的狀態下＜8cm，從而不能夠完成正常的性生活，但多數情況下人們所說的陰莖短小很多都是主觀癥狀，即主觀上覺得自己的陰莖短小，但經客觀的醫學評估，陰莖的發育是在正常范圍，若僅是主觀上覺得陰莖短小，并不會影響生育，只要能夠正常完成性生活，就完全有希望有自己的后代。 臨床上有一類真正的陰莖短小是指勃起后陰莖＜8cm或者更小，不能完成正常、滿意的性生活，從而影響到精子和卵子的結合，最終影響生育。這時需要采取醫學干預，如通過手術、人工受孕等方法，使陰莖短小的患者有機會有自己的寶寶。另外，有部分陰莖短小是指在性生活的過程中滿意度過低，這種情況下可輔助于某些藥物達到生育的目的。