囊腫的癥狀可以完全沒有，也可以有胃腸道反應，如果囊腫擴大造成壓迫。由于囊腫有一些功能，可以分泌雌孕激素而導致月經不調，因此囊腫可以有癥狀，也可以沒有癥狀。囊腫多數是在體檢時或無意中發現，B超發現居多，醫生在體檢時用手檢查發現一側有囊腫，可以通過B超可以看到囊腫位置、大小，是來自卵巢還是子宮，此時還需查腫瘤標志物，看看是良性還是惡性。至于臨床癥狀，部分患者是由于胃腸道不適去其他科室檢查偶爾發現，因此囊腫單純靠癥狀來診斷并不非常適合，主要靠B超篩查。正常女性建議一年至少做一次B超檢查，如果有肌瘤，則還要進一步縮短檢查時間。囊腫有良惡性、生理性、病理性區分，因此多次B超有時是必要的。