腺病毒感染沒有特效藥，所以治療方法為綜合治療，幫助病人渡過難關。因腺病毒肺炎是肺部炎癥，治療原則為消除炎癥，改善通氣。所以這類病人需給氧支持，保持呼吸道通暢。而肺炎治療原則為對癥治療，出現高燒的患者需降溫；如果氣道炎癥嚴重，符合嚴重的中毒癥狀，可使用糖皮質激素、丙種球蛋白。 腺病毒肺炎沒有特效藥，有時醫生會用病毒唑類藥物，但效果不確切。腺病毒感染后可導致免疫功能的損害，通常合并細菌感染。所以當有細菌感染的苗頭時，需要給予患者抗生素治療。