淺表性胃炎可能還有幽門螺桿菌感染，并且多數淺表性胃炎是由幽門螺桿菌感染引起。大概有90%以上的淺表性胃炎患者感染過幽門螺桿菌或正在感染幽門螺桿菌，而感染幽門螺桿菌的患者90%-100%會出現胃炎。感染幽門螺桿菌最初主要表現便是慢性淺表性胃炎，所以淺表性胃炎和幽門螺桿菌感染通常同時存在。幽門螺桿菌的感染，可以通過某些檢測手段對其進行檢測，例如可以做碳13、碳14的呼氣試驗或做胃鏡、組織學的檢查，在顯微鏡下可以觀察到細菌或做細菌的培養等。如果確定有幽門螺桿菌的感染，便要進行根除幽門螺桿菌的治療，才能達到治愈淺表性胃炎的目的。