目前臨床上治療乙肝的藥物，主要是核苷類似物和干擾素，核苷類似物中常用的有三種，具體如下：一、恩替卡韋：大量的研究數據顯示，采用恩替卡韋治療可強效地抑制病毒的復制，改善肝臟炎癥，安全性較好。長期治療可改善乙型肝炎肝硬化患者的組織學病變，顯著降低肝硬化的并發癥和原發性肝癌的發生率，降低肝臟相關和全因的病死率。在初治的慢性乙肝患者中，恩替卡韋治療5年的累計耐藥發生率為1.2%；二、富馬酸替諾福韋酯：應用本藥物治療慢性乙肝的多中心臨床研究結果顯示，可強效地抑制病毒復制，耐藥的發生率低。治療8年的研究數據顯示，僅有極少數人發生了病毒學突破，其中大多數病例的原因是依從性問題。約有59%的人發生病毒性突破的患者，繼續應用富馬酸替諾福韋酯治療，仍然獲得了病毒學應答。長期治療可顯著改善肝臟的組織學，降低原發性肝癌的發生率；三、富馬酸丙酚替諾福韋酯：是一種新型的抗病毒藥物，實際的抗病毒效果要與其他藥物，如恩替卡韋差不多，但對于患者的腎臟，和骨骼的安全性，得到明顯的改善。一般來說，本藥物適用于下列患者：1、所有符合抗乙型肝炎病毒治療指征的乙型肝炎患者和肝硬化患者；2、單藥耐藥或核苷療效差的患者；3、其他藥物耐藥的患者；4、尤其適用于腎功能異常的患者。另外，慢性乙肝患者可以使用干擾素進行抗病毒治療，但干擾素的不良反應比較多，并且有相關使用的禁忌證。所以在治療期間需要完善相關的檢查進行排除，如果患者的肝功能損害比較重，膽紅素大于正常上限的2倍以上，不建議使用干擾素治療。可以等肝功改善之后再使用干擾素抗病毒治療，在治療過程中也需要定期門診隨訪。