小兒腦發育遲緩，需積極尋找病因，如是否存在慢性宮內乏氧，或出生時是否存在窒息、缺血、缺氧，以及出生后是否存在高膽紅素腦病、中樞神經系統感染，都會導致小兒出現腦發育遲緩。這時主要針對原發病進行積極治療，同時根據腦發育遲緩的臨床表現，給予針對性干預治療，如果小兒智力發育遲緩，可重點進行智力開發。如果存在大的運動發育遲緩，則主要針對大運動方向，進行專項康復訓練，可主動、被動訓練相結合。如果小兒語言發育遲緩，則重點針對語言遲緩進行專項訓練。通過不同程度的康復訓練，改善小兒大腦發育遲緩程度。此外部分小兒大腦發育遲緩，可能是由于先天遺傳代謝性疾病造成，如特殊的線粒體腦病，這時除康復訓練外，還需配合特殊的藥物進行治療。