體外在震結石或沖擊波碎石時，患者通常感覺較痛。打結石是能量穿透皮膚把腎臟里面的結石打碎，所以能量較大，而且能量聚焦在一個點，因此可能造成疼痛。體外碎石之前在皮膚表面定點，定點后能量集中在此點把結石打碎，患者會在震時或者在打結石時出現疼痛。有些碎石患者體外打完結石以后，出現血尿伴有血塊，就是因為能量對腎臟本身產生損傷。有些醫院在碎石時，會出現把握不好的情況，打的時候把腎臟打碎，或者把腎臟打破，需要格外注意。在碎石之前，常規給患者應用止痛劑，比如肌肉注射杜冷丁，預防在碎石過程中出現疼痛不能耐受的情況。