通常骶管囊腫不會自動消失，骶管囊腫的發病原因目前尚未明確，大致推測可能與骶管附近的炎癥、外傷或者運動不當等相關。骶管囊腫包括和腦脊液相通的類型，以及和腦脊液不相同的類型，但無論是否相通，骶管囊腫自動消失的可能性都比較小。因為相通時腦脊液可以自動流入到囊內，而且囊腫自身分泌的囊液也會存在，所以絕大多數骶管囊腫不能自行消退。當患者產生臨床癥狀時，可以通過介入或者外科手術進行治療，從而緩解相關癥狀。