患者一般做氣管鏡檢查之前，醫生都會進行充分的術前檢查，如心電圖檢查、血常規檢查、凝血功能檢查等。如果患者風險相對較高，醫生會與患者溝通，可能會取消相關檢查。但如果醫生感覺能夠耐受的情況下，做普通氣管鏡一般都相對比較安全，風險性可能低于1/10000，而風險主要在于麻醉過敏。整個支氣管鏡檢查過程中，一般比較安全。 但當要進行比較復雜的操作治療，如進行活檢、腫瘤治療、支架釋放等，相對風險性就更高，所以也存在一定危險性。雖然氣管鏡有相關危險性，但醫生會根據病情評估，權衡利弊，如果確實有必要進行檢查或治療，希望患者能調節心態，配合醫生完成。一般都是有豐富臨床經驗的醫生操作。