對于肝吸蟲，可以選擇藥物性殺蟲治療，不涉及手術風險，在治療過程中要評估肝吸蟲引起的損傷程度。肝吸蟲主要存在于肝膽管系統，可以引起膽管炎、膽囊炎、膽囊結石，還有部分患者可以出現肝臟內膽管病變，以至形成肝膿腫或肝臟大面積的炎癥損傷。此時要通過MRCP(磁共振胰膽管造影)或ERCP(頸內鏡逆行性膽管造影術)，來判斷肝膽總管系統中是否存在肝吸蟲成蟲。如果有成蟲，可以先取出，更有利于后續的殺蟲治療。如果沒有成蟲，常規使用吡喹酮殺蟲治療即可。如果僅是膽囊炎，可能進行一個療程的治療即可。但如果合并肝臟膿腫或肝臟大面積炎癥損傷，則需要治療幾個療程，直到肝臟病變穩定或血常規嗜酸性粒細胞穩定并不再增高，以及大便中沒有蟲卵等，來確定最終治療的結束時間點。肝吸蟲治療應盡早進行，因為一旦感染肝吸蟲后形成膽管病變，將來有發展為膽管癌的風險。