腦血栓經過急性期積極治療，大部分患者會有明顯的功能改善，6個月之后，仍有部分患者會出現一定的神經功能不足考慮為后遺癥。可以表現為語言交流費力或者不能理解他人言語、吞咽困難、不能自己進食、喝水，或者肢體功能癱瘓需要家人伺候，雖然能站立起來需要借助相關工具如拐杖進行行走。有一些患者會出現肢體麻木甚至可以影響夜間入睡。出現后遺癥不能過于焦慮、自暴自棄，應該積極按時藥物治療減少腦血管的危險因素，控制血壓、血糖，并且在神經功能康復師的指導下進行認真的積極康復訓練。