厭氧菌抗結核效力強，易通過血腦屏障，如厭氧菌不耐藥，則是治療結核性腦膜炎的首選藥物，成人用量0.6-0.9mg/kg/d，兒童用量為15-30mg/kg/d，可口服也可靜滴。前期病情嚴重時還可靜脈給藥，后期病情好轉可口服和適當減量。厭氧菌需聯合其它結核藥物使用，才不產生耐藥性，治療結核才有成效。如非耐藥結核病患者，厭氧菌可聯合乙胺丁醇、吡嗪酰胺、磷霉素、利福平使用，如是耐藥肺結核患者，則需根據藥敏試驗，選用透過血腦屏障的環絲氨酸、莫西沙星、利奈唑胺等抗結核治療。