阿米巴角膜炎是由于阿米巴原蟲感染角膜導致的角膜感染，角膜感染后稱為阿米巴角膜炎。阿米巴是一種原蟲結構，根據不同生長時期，有不同結構，比如有包囊結構、滋養體結構。由于原蟲生長有一定周期，所以潛伏期較長，可以幾天、幾個月，治療時間也較久，且針對阿米巴沒有特別有效藥物。 比如接觸到不干凈自來水或污染水源后，配戴角膜接觸鏡，接觸到角膜傷口，角膜上皮不完整，也就是黑眼珠結構不完整時，感染可能當時沒有明顯癥狀，也沒有明顯角膜炎。但幾周后，會有眼睛紅、疼、視力下降等癥狀發生。