小孩子早上起床咳嗽，如果是短期內發生，持續時間不長，考慮感染引起的可能性比較大，常見情況如下：1、病毒感染：常見的病原體包括呼吸道病毒，如合胞病毒、腺病毒、流感病毒、副流感病毒、鼻病毒等；2、細菌感染：如果癥狀不重可以先口服藥物進行止咳化痰對癥處理，必要時可以配合霧化吸入的藥物進行化痰處理。經過治療部分患者能逐漸緩解，部分可能沒有緩解。如果有細菌感染要選用敏感的抗生素，進行抗細菌治療；3、支原體、衣原體感染：需要進行對癥處理，需要加用大環內酯類藥物抗支原體、衣原體；4、過敏性原因：如果經過足療程抗感染、對癥處理，癥狀沒有緩解，早上起床咳嗽，每天都咳，其他時間咳得不多或者其他時間不咳，咳嗽持續1個月以上，要考慮非感染性咳嗽，如與過敏相關的咳嗽變異性哮喘或者過敏性咳嗽。必要時要完善過敏原、肺功能、呼出氣一氧化氮等相關檢查，進一步明確病因。