胃鏡主要是從口腔到咽喉部，然后到食管，最后進入胃，所以對于食管和胃，胃鏡檢查還是能夠做到的，而且是相對比較充分的。胃鏡過了口咽以后，在進鏡和推鏡的過程中，通過對食道和胃的黏膜進行詳細的觀察。食管和胃的糜爛、潰瘍、血管曲張，或者新生物，甚至腫瘤，通過胃鏡的檢查，多數是可以發現的。 有些普通胃鏡發現不了，現在又有新的技術手段，通過超聲胃鏡可以透過食管和胃壁，透過黏膜面看到肌層、漿膜面甚至更深層的組織。所以現在胃鏡和超聲胃鏡對于食管和胃疾病的診斷有很大的幫助。