胃鏡對胃內明確的胃黏膜病變都可以發現，比較常見的包括胃的炎癥、糜爛、潰瘍、腫瘤和其他食管病變。因為胃鏡一定會經過食管，所以食管的炎癥、潰瘍、狹窄、腫瘤等都可以檢查出來。有的病人可能出現各種不舒服、肚子痛、吃飯不順暢或嗓子不舒服等情況，做完胃鏡檢查后卻沒有發現任何疾病，是因為胃鏡只能發現明確的病變，也就是醫學上常說的器質性病變，即有沒有真正的器質性問題，胃鏡沒有發現問題，只能說明沒有器質性問題。但胃鏡無法檢查出功能性問題，比如胃腸道蠕動問題、植物神經功能調節問題，或者胃腸道內氣體脹氣引起的問題。雖然胃鏡是目前最直接的、最好的，能檢查出胃部器質性病變的辦法，但它并非萬能。必須在胃鏡下排除掉器質性病變，才能診斷胃腸功能紊亂病變，所以目前只要有胃部癥狀，懷疑有胃部病變時都應做胃鏡檢查。