慢性萎縮性胃炎和十二指腸假性憩室，實際上可能是2個問題。治療主要針對以下幾種癥狀：1、萎縮：避免萎縮加重形成異型增生、上皮內瘤變問題，通過藥物進行治療；2、十二指腸假性憩室：實際上沒有特殊治療，十二指腸假性憩室的成因多半是與既往十二指腸潰瘍有關。雖然潰瘍已經愈合，但是造成局部的結構改變，絕大多數十二指腸假性憩室不一定會引起癥狀。有很多情況下，在假性憩室旁邊可能會合并潰瘍形成，這時可能需要用藥進行抑酸治療。以上2種情況實際上，共同問題都需檢測幽門螺桿菌。針對慢性萎縮性胃炎，根除幽門螺桿菌有助于預防進一步發展。針對十二腸假性憩室，基本既往多半有十二指腸潰瘍，通過發現、根除幽門螺桿菌，有助于減少和避免潰瘍復發。如果發現幽門螺桿菌，進行根除幽門螺桿菌治療是治療的一方面，需要注意并進行處理。