胚胎停育原因非常多，臨床上比較常見的原因就是胚胎染色體異常。胚胎的染色體異常有可能是遺傳原因導致，也有可能是偶然發生的染色體畸變導致的胚胎停育。如果是遺傳原因導致的染色體問題，導致胚胎停育，需要檢查父母雙方的染色體是否存在染色體遺傳性疾病，并尋找是否是存在治療的方法可避免再次胚胎停育；如果是偶發的染色體畸變導致的胚胎停育，則無需進行特殊治療，只是一個偶發事件。 引起胚胎停育的原因還有可能會存在風濕免疫系統疾病，臨床上常見的是抗磷脂抗體綜合征或者系統性紅斑狼瘡，很容易導致胚胎停育。評估的方法也比較簡單，進行免疫指標檢測，再結合患者的病史即可確診。