臨床上常見的支原體，如感染肺炎支原體后可以引起發熱、咳嗽、咳痰等表現。而肺部體征，做影像學檢查能看到肺部炎癥表現，此為臨床上肺炎支原體主要的表現。 如果是生殖系統感染支原體，如解脲支原體感染，在男性可引起尿頻、尿急、尿痛等泌尿系急性感染的臨床表現。女性感染可引起陰道炎癥，還有宮頸炎，宮頸炎可出現局部潰瘍、糜爛、水腫等表現，而生殖器感染經過性行為可以互相傳染。