男性小腹疼痛，需要根據其不同的情況做相應處理，具體如下：1、糾正腸功能紊亂：腸功能紊亂一般是由自主神經功能紊亂所引起，小腸失節律性的收縮或者是不收縮引起疼痛。這時候可以吃些糾正腸功能的藥物，比如有得舒特(匹維溴銨片)、援生力維(馬來酸曲美布汀片)等，可以集中緩解腹痛；2、糾正腸道菌群失調：另外可以糾正一下腸道的菌群失調，補充一些益生菌，比如有乳酸桿菌、思連康(雙歧桿菌四聯活菌片)、常立寧(酪酸梭菌活菌片)等等益生菌。很多藥房表明需要益生菌，都可以找出，有二聯、三聯的都可以。還可以喝酸奶，每天堅持喝一杯酸奶都有好處。如果經過這些調理，糾正胃腸道功能紊亂，糾正菌群失調，補充益生菌，一般有1個月如果還不緩解，就要考慮有沒有其他疾病。這時就需要去結直腸外科檢查，有沒有其他的比如腸道上，結腸、直腸有沒有病變。常見的有潰瘍性結腸炎、直腸腫瘤、結腸腫瘤，明確有沒有這些疾病，通常還需要做結腸鏡檢查。以及盆腔有沒有其他的器官，比如膀胱、前列腺有沒有疾病，這種需要做盆腔彩超、泌尿系彩超或者是做盆腔磁共振、腹部CT檢查，明確有沒有器質性病變。