男性小腹疼痛的原因主要有以下幾個方面：1、小腸疾病：小腸腸功能紊亂會引起小腹疼痛，正常人小腸每分鐘收縮3-5次，呈節律性收縮，腸功能紊亂時小腸收縮就會失去節律，快速時每分鐘收縮7-8次，這樣會引起疼痛。如果小腸不運動會引起脹氣、積液，也會導致腹部脹痛。小腸發生器質性病變，比如小腸腫瘤中的間質瘤、小腸腺癌，或者小腸炎癥性病變，包括克羅恩病、腸結核等也會引起小腹疼痛；2、結腸疾病：左半結腸、直腸如果存在病變，比如直腸癌、直腸腺瘤、乙狀結腸腺瘤、乙狀結腸息肉等，會引起小腹疼痛。還有乙狀結腸、直腸存在炎性病變，常見的是潰瘍性結腸炎，也會引起小腹疼痛；3、其他原因：盆腔的臟器病變，比如膀胱腫瘤、膀胱炎癥、膀胱結石會引起小腹疼痛。男性的精囊腺和前列腺如果存在病變，比如前列腺炎、前列腺癌也會引起小腹疼痛。