男性小腹疼痛的原因，可能有以下幾個方面：1、實質性臟器的病變：如小腸炎性疾病、克羅恩病、腸結核，以及小腸的腫瘤、間質瘤等。除小腸疾病外還需考慮，有無左半結腸和直腸的疾病，如乙狀結腸憩室、乙狀結腸炎、直腸炎，以及常見的潰瘍性結腸炎、直腸癌、乙狀結腸癌，還有直腸和乙狀結腸腫瘤。考慮小腹痛有無膀胱腫瘤、膀胱炎癥，以及精囊腺和前列腺的腫瘤等，均會引起男性小腹疼痛，可通過CT、超聲或者腸鏡檢查此類疾病；2、植物神經功能紊亂：當植物神經功能紊亂引起腸功能紊亂，常見小腸功能紊亂，表現為腸管一過性痙攣性收縮，從而引起陣發性小腹疼痛，此時可口服調解胃腸道功能的藥物如得舒特，再補充益生菌后該癥狀可得到緩解。