若患者存在急性化膿性扁桃體炎或急性扁桃體炎，懷疑是由于細菌感染引起，患者不存在青霉素過敏的情況下可以考慮使用阿莫西林進行治療。若患者在感冒多發的季節，可能會由于感染性的因素而導致咽痛，且扁桃體的表面會存在分泌物，伴有化膿表現或咽痛較明顯。患者在進行血常規檢查時發現C反應蛋白、白細胞總數以及中性粒細胞增加，在懷疑為細菌感染時，并且在無青霉素過敏史的情況下，可以考慮口服阿莫西林進行藥物治療，并且患者也可以配合使用傳統的中藥，如清熱解毒類藥物，以緩解急性扁桃體炎的癥狀。患者還可能由于慢性扁桃體炎或其他因素造成扁桃體炎，如患者由于過敏因素、胃食管反流刺激或其他不良嗜好而造成慢性扁桃體炎，此時患者僅口服阿莫西林無效。所以阿莫西林僅針對細菌感染造成的急性炎癥表現存在療效。