患者晨起時出現小便疼痛癥狀，常見原因如下：1、尿路感染：膀胱、尿道出現炎癥時，可能在排尿過程中患者會出現下腹部或沿尿道放射性疼痛。因晨起時尿液最為濃縮，夜間飲水較少，尿液中白細胞或細菌成分可能會相應增多，此時患者排尿時刺痛感較強；2、排尿間隔較長：尿液中細菌繁殖量較大，同樣會刺激尿道，進而導致患者產生排尿時刺痛或灼痛不適感。因此，患者出現晨起排尿疼痛時，建議到醫院進行尿常規檢測，通過白細胞數變化，可明確是否存在膀胱、尿道炎癥，確診后可應用抗生素進行治療。