對大多數人來說，纖維喉鏡檢查不痛苦，因為它是一種無創檢查。常規檢查中，主要是通過可彎曲的光纖從鼻腔進入，對鼻咽、喉咽等部位進行檢查。在檢查以前通常都會進行局部麻醉，即局部噴地卡因，以減輕病人的痛苦，并收縮鼻腔。 纖維喉鏡雖然只是通過的作用，對大多病人來說都可耐受，有些病人因為痛閾的不同，可能會有不舒服，局部黏膜會有些刺激感，有分泌物增加等不適，但是這種不適在檢查后1-2個小時就會逐漸減弱和消失，不需要進行藥物或者其它的治療。所以對于大多數人來說，纖維喉鏡是一種比較可選、不痛苦的檢查。