通常患者進行輸精管造影檢查并不會感覺到痛苦，可能在針對輸精管進行穿刺時會出現疼痛、不適感。輸精管造影為一項可有效了解輸精管病變的檢查，檢查過程患者需平躺，醫生從陰囊根部進行觸摸，用手固定住輸精管，另一只手持穿刺針刺入輸精管中，穿刺過程患者會感覺疼痛。而后再置入一根能夠注射的導管，將造影劑推注到輸精管中，在X光下進行照射。但在真正穿刺前，醫生可能會局部注射麻醉藥物以減輕疼痛不適，置入穿刺針后，患者痛苦感不會過于明顯。整個過程患者平躺在操作臺，注入造影劑后進行X光照射，了解造影劑在輸精管內位置，以方便了解輸精管內結構。當照射完成后，醫生拔出穿刺針局部按壓再覆蓋敷料。因此，整個操作過程較痛苦的為進行穿刺過程，如果時間較短時，絕大部分患者可以忍受。