巨指癥的治療在不同階段需要不同的處理，先要觀察巨指癥的生長速度，對于生長速度很快，而且出現偏斜的情況，應該要早期處理。早期處理就是要做脂肪和神經松解，對于稍微大一點的患者，比如接近青少年的患者，這個時候可以做骨骺阻滯來減緩骨的變化。對于骨質生長已經停滯的患者，這個時候需要做截指術，或者是外形的重建術。對于巨指癥建議早期干預、早期處理，尤其是減容術、骨骺阻滯術，需要多次手術，經過多次的手術才能夠比較有效的減緩它的生長速度，因此需要引起重視。巨指癥在每個年齡段，都需要進行定期的檢查和定期隨訪，而且也要進行定期干預，最后才能夠取得一個比較好的效果。