腳趾頭起水皰有以下幾種常見的原因：1、運動摩擦：運動穿鞋跑步，跑步時間長，腳趾頭會磨起皰，因為腳趾頭和鞋子的摩擦運動引起起皰的情況；2、腳癬：真菌感染后引起腳癬也會在腳趾頭上起皰，會瘙癢；3、熱水燙傷：冬天用熱水袋，熱水燙傷起皰，這是外在因素；4、其他皮膚病：如天皰瘡、類天皰瘡，可以全身發皰，腳趾頭上也會起皰；5、藥物：藥物過敏后全身會起皰，腳趾頭也會起皰。