目前臨床上器官移植的排斥反應有幾種方法進行分類，按照類別分成急性排斥反應、超急性排斥反應、加速性排斥反應，以及屬于亞臨床性排斥反應及慢性排斥反應。 按照機理來說，分為體液性排斥反應與細胞性排斥反應。其中超急性排斥反應是因為體內預存抗體識別抗原，發生排斥反應。做完手術后馬上移植物會出現缺血、血栓、急性壞死，無法逆轉，必須將移植物切除；加速性排斥反應治療較困難，最終結局可能要將移植物切除。 急性排斥反應發生行移植手術的半年左右，也可能發生于術后的任何時刻，排斥反應80%以上可逆轉；慢性排斥反應目前沒有特別好的辦法進行治療，可能五六年、十多年后發生慢性移植物腎病。