直腸癌化療和其他腫瘤化療相同，均可引起常見的副反應，即骨髓抑制，白細胞降低。通常要根據白細胞降低的程度，給予病人合適的處理。一般對于中度以上的白細胞降低，即Ⅰ-Ⅱ度的白細胞降低，可以進行升白細胞治療，同時囑咐病人預防感染。 對于重度的即Ⅲ-Ⅳ度的白細胞降低，除應用升白細胞的藥物，如一些集落刺激因子外還要注意病人的隔離消毒。對于合并感染傾向的病人，甚至要預防性應用抗生素類的藥物。