針灸對人體相對比較安全，但并不是絕對不會造成傷害。針灸有一定的副作用，比如針刺有創口，而且針具中的小針刀創傷會更大，也會對人體會造成疼痛，造成肌腱、神經損傷，如果針刺到胸胸腔中，還有可能會造成氣胸，但只要嚴格按照操作規程，一般不會出現問題。針灸的治療原理是通過調節人體內在的機能來治療疾病，多數穴位可以通過針刺進行雙向調節，比如心率快或者慢都可以針刺內關穴，而且正常人扎內關穴不會對心率產生影響，腹瀉和便秘時都可以針刺天樞穴，所以這種治療方法相對比較安全。相對于艾灸，如果藥不對癥則容易上火，這也是艾灸的副作用，所以針灸相對比較安全。