緊急避孕藥不容易導致宮外孕。現在大樣本臨床分析，口服緊急避孕藥與不口服緊急避孕藥的病人，發生異位妊娠的可能性一樣，理論上口服緊急避孕藥并不增加發生異位妊娠概率，但緊急避孕藥會抑制受精卵著床，這種情況影響進入宮腔，如果形成受精卵，可能異位其他位置。因此；從緊急避孕藥的說明和藥物機制觀察，其實容易引起宮外孕。病人可以口服緊急避孕藥防止非意愿性妊娠，但是避免將緊急避孕藥作為常規的避孕方法，因為緊急避孕藥含雌孕激素比例要比短效避孕藥高，因此對于卵巢功能及子宮內膜和輸卵管內膜的干擾比較大。如果常規口服緊急避孕藥進行避孕，容易出現卵巢功能失調，引起月經失調，以及子宮內膜不規則增生。緊急避孕藥相對副反應較大，有可能影響孕卵游走和孕卵著床，這種情況有可能會引起宮外孕。因此若偶爾在沒有預料的情況下發生性行為，可以口服緊急避孕藥，但避免將緊急避孕藥作為常規避孕方法。