針灸與艾灸并不沖突，即針灸的同時可以進行艾灸。因此若需分時間前后，針灸后當時便可以進行艾灸。針灸主要起到通經活絡、調和陰陽、疏通氣血作用，相對較平和，以通、調為主要功效。而艾灸為熱性治療，具有溫通經絡、回陽、助陽及活血化瘀作用，活血化瘀作用主要在于溫熱，造成氣血循環加快。因此艾灸與針刺通經活絡作用較不相同，兩者完全可以結合使用。臨床有種治療稱為溫針灸，即將針刺入人體后，在上方插入一段艾條，點燃艾條。在針刺同時進行艾灸，對寒濕性疼痛有較好的治療效果，常用于治療類風濕性關節炎，效果較好。因此針刺、艾灸可同時運用，部分情況下若患者較不方便，可針刺后選部分特殊穴位進行艾灸。