艾灸與針灸可同時進行，艾灸屬于溫熱治療方法，主要有溫通經絡、活血化瘀及壯陽、補陽作用；針刺主要有疏通經絡、調理氣機作用，二者沒有沖突可同時操作。若疾病需進行溫通治療時，還可應用溫針灸方法，即在針上插一段艾灸，將針刺入穴位，再點燃針柄上的艾灸條，對于類風濕關節炎患者手指關節腫脹、疼痛有較好療效。通常艾灸與針灸同時進行情況比較少，因兩者操作有一定差異。針刺相對比較簡單，直接刺入人體即可；而艾灸有時需應用器具或醫生拿艾條進行懸灸或雀啄灸等，操作比較費時，但現在可應用艾灸器具進行治療，相對比較輕松。