對于肝內膽管結石，通過藥物排出結石存在一定難度，臨床一般予以手術治療。根據膽管的特異性走行，可以將膽管比作縱橫交錯、非常復雜的樹枝，理論上每個膽管均可能出現結石。肝內膽管結石通常呈泥沙樣，膽色素成分較多，結石附著于膽管壁，呈淤泥樣。結石積累至一定程度，可導致膽管擴張，引起部分肝段或者肝葉萎縮，需及時手術處理。臨床切開膽管后，通過膽道鏡沖洗膽管，通常需使用大劑量生理鹽水反復沖洗才可有效清除結石。針對少量殘余結石，術后可進行膽道鏡取石，臨床不建議采取藥物治療。