先天性心臟病主要因心臟胚胎發育階段發育畸形導致。個別先天性心臟病可能與基因存在一定關系，但并非代表先天性心臟病與遺傳相關，因此先天性心臟病患者通常無需擔心遺傳下一代。 通常情況下，簡單性先天性心臟病基本無法影響患兒的生長發育及自然壽命。但部分復雜性先天性心臟病患者處于妊娠期時，需聽從醫生建議，并完善檢查進行相應評估。