結腸炎的藥物治療從西醫來講有以下藥物。氨基水楊酸類，現在常用的美沙拉秦制劑，包括腸溶顆粒和腸溶片，還有灌腸藥是美沙拉秦栓劑，美沙拉秦的灌腸劑等，都是一類藥物。這類藥物對輕度和中度炎性腸病效果比較好，比較重度的情況下可能就得需要補液。適當情況下要應用抗生素，然后應用激素類的藥物。在臨床上更多采用中醫中藥的治療，中醫中藥的辨證論治的方法在臨床上有比較好的療效，能夠誘導緩解，而且能夠長時間的維持緩解狀態，預防復發。現在研究有中藥在預防癌變方面也有很明顯的作用。