青少年良性癲癇以藥物治療為主，根據患者發作類型、發作特點、腦電圖特點選用抗癲癇藥物，如奧卡西平、左乙拉西坦、德巴金等，多數患者通過藥物治療也獲得較好療效。有些類型的良性癲癇睡眠中出現加劇，稱為睡眠中的癲癇性持續狀態，此時需進一步調整用藥，盡量避免使用加重腦內部損傷的藥物。良性癲癇要先判斷是否需要治療，明確需要治療后首選藥物治療。 青少年良性癲癇如果發作頻率較低，如一年一次或者一年兩次，則不需要治療。如果發作頻率較高，如半年內發生三次或者一年發生四次，則發作頻率較高，需要治療。良性癲癇大部分為夜間睡眠中發作，如果出現白天發作也需要治療。發作持續狀態，如半小時及以上較長時間的發作也需要治療。