非典型性肺炎不需要隔離，好發于兒童和青壯年，由于自身免疫力比較強，在感染非典型性病原體后，比如支原體、衣原體，相關的病原體，存在自愈傾向，比較嚴重患者需要積極就醫。人群之間相互傳播此病的幾率不高，但是小的嬰兒免疫力下降，在小范圍內流行，比如幼兒園、學校機構相互傳染。有類似的情況、相關癥狀，建議隔離、注意開窗通風。家庭成員之間相互傳播幾率也不高，但是兒童和兒童之間有可能傳播，盡量避免兒童和兒童之間的接觸。另外，不要把非典型性肺炎與2003年SARS病毒感染相混淆，SARS病毒剛發現的時候，因為也是不明原因的病原體，所以稱為非典型性肺炎，但是與目前非典型性肺炎不一樣。2003年的非典型性肺炎即SARS病毒傳播方式經過呼吸道飛沫傳播，而且傳染性特別強，要嚴格隔離，如果接觸病原體后嚴格隔離2個星期才能與其它人接觸。