嬰兒的腳底長水皰，一般有以下幾方面的原因：1、不合適的鞋子：鞋子不合適，局部摩擦導致嬰兒腳底長水皰，此時水皰還會伴有疼痛；2、病毒感染：如手足口病，孩子除腳上長皰外，手以及口腔內，甚至臀部，也可以出現皰疹，同時還可伴有不同程度的發熱或進食困難、口腔疼痛。此時給予對癥抗病毒治療1周左右，臨床癥狀可以逐漸恢復，皰疹可消失。還有一部分病毒感染也可以引起腳底長皰，例如水痘病毒。患有水痘時，孩子除腳底長皰外，身體的軀干部分也可出現皰疹。而且水痘的皰疹一般伴有明顯的瘙癢，此時孩子會覺得局部癢感明顯，會抓撓，抓撓后皰疹馬上進入破潰狀態，再結痂。皰疹愈合后，水痘疾病就會恢復正常；3、真菌感染：局部真菌感染引起足癬，此種情況下，一般是孩子不注意個人衛生，或與其他人共用鞋襪導致。此時積極給予抗真菌治療后，孩子腳底長皰的癥狀會逐漸減輕和消失。