腎結石引起腎萎縮后，通常出現下述情況需要進行切除：1、繼發高血壓：患者由于腎結石引起腎萎縮，進而引發局部腎缺血，使得腎素分泌過多，出現繼發性高血壓、腎病高血壓。若高血壓的病因由于腎萎縮性導致，則服用藥物控制較差，此時患者可能需要進行手術切除萎縮腎臟，避免損害身體；2、繼發感染：若患者合并頑固、反復、嚴重感染，則需切除患腎即可控制感染，進而減輕由感染導致不利表現，比如疼痛、全身炎癥等。因此，患者由于結石導致腎萎縮，合并腎性高血壓、嚴重感染時，可能需要手術切除患腎。