多囊腎是先天遺傳性疾病，目前為止確實沒有太好的治療辦法。但目前多囊腎治療可選擇的藥物是托伐普坦，托伐普坦被認為對于遺傳性的多囊腎有一定控制囊生長的作用。但托伐普坦的治療對腎功能有要求，腎功能水平應該是早期輕度升高的情況。如果多囊腎的囊生長速度非常快，可以用托伐普坦實驗性治療來降低囊的生長。其它的多囊腎藥物主要是針對多囊腎并發癥，如多囊腎病人比較容易出現高血壓情況，所以早期會發生高血壓，會選擇降壓藥物，首選的降壓藥物是RAAS阻滯劑，包括沙坦類降壓藥物和普利類降壓藥物。在此基礎之上如果血壓控制不好，還會選擇CCB類降壓物，或者β受體阻滯劑、α受體阻滯劑。可以5種降壓藥物良好組合，目的就是把血壓控制到最好。另外一大類藥物基于多囊腎的腎功能來進行，如果已經發生腎功能不全、腎衰竭，醫生可能會給排毒藥物來延緩腎臟病進展。但總體而言，多囊腎因為沒有非常針對性的藥物治療，其只是遺傳性腎病，所以在臨床上確實只針對并發癥的治療。